2009-ben jelölve lett a Satellite-díjra mint Legjobb férfi mellékszereplő egy sorozatban.

2010-ben megnyerte Screen Actors Guild-díjat a Glee-ben való remek alakításáért. Jelölve is lett még kétszer ebben az évben egy Emmy-díjra mint Legjobb mellékszereplő egy sorozatban, majd ugyanebben a kategóriában ismét egy Satellite díjra.

2011-ben ismét nyert, egy Golden Globe-díjat mint Legjobb férfi mellékszereplő egy sorozatban. Ebben az évben három jelölést kapott: Screen Actors Guild-díj mint Legjobb színész egy vígjáték sorozatban, Screen Actors Guild-díj mint Kiváló alakítás egy sorozatban, és nem utolsó sorban Emmy-díjra is mint Legjobb mellékszereplő színész egy vígjáték sorozatban.

A 2012-es Teen Choice Awardson két kategóriában is jelölve lett, egyik mint a Legjobb színész egy vígjátéksorozatban, a másik pedig mint a Legjobb férfi divatikon, az előbbit megis nyerte, míg utóbbit sajnos elvitték előle.

2013-ban elnyerte a Kedvenc Színész Vígjátéksorozatban díjat a People Choice Awards-on.

2011 április 11-én  Colfer neve említésre került a 2011-es Time 100-ban, amiben a Time szerint a 100 legbefolyásosabb ember szerepel.